Phân loại proteomics

PHÂN LOẠI PROTEOMICSNguyễn Phương Mai, Lê Thị Liễu, Phương, QuyPROTEOMICS BIỂU HIỆN (1)Định nghĩa:Nhận biết protein và phân tích định tính (chất lượng)Tính chất:Phân tích thành phần các protein riêng biệt có trong hỗn hợp protein phức tạpNhận biết các yếu tố cấu thành và phân tích số lượng tổng hợp Phương pháp nghiên cứu:2DGE: điện di hai chiềuHPLC: sắc ký lỏng cao ápMS: mass spectrometryMultiD-LC, multidimensional liquid chromatography.PROTEOMICS BIỂU HIỆN (2)Twyman R. M. 2004. Principles of proteomics. BIOS Scientific Publishers. p19Hàng nghìn loại protein có thể được phân tách, định lượng và nhận biết nhanh chóngNhận biết các loại protein được sản xuất trong tế bàoNhận biết các loại protein biểu hiện khác nhau giữa các mẫu khác nhau và các đặc điểm biến đổi trước quá trình dịch mãSử dụng protein chips trong phân tích và định lượngPROTEOMICS BIỂU HIỆN (3)Định nghĩa:Các thay đổi trong biểu hiện protein trong các quá trình biệt hoá, tăng sinh và truyền tín hiệu của các tế bào cả về mặt chất lượng và định lượngTính chất:Nghiên cứu về sự biểu hiện của gene Trình tự quá trình điều khiển trong các giai đoạn mà một tế bào hoặc một tổ chức cơ thể phải trải qua trong suốt quá trình sống PROTEOMICS CHỨC NĂNGĐịnh nghĩa:Nhận biết cấu trúc phân tử của protein: Trình tự amino acid Tính chấtNhận biết trình tự gene tương ứngPhương pháp sử dụng: Mass spectrometryPROTEOMIC CẤU TRÚC (1)Trình tự, cấu trúc và chức năng của protein có liên hệ mật thiết với nhau Là cơ sở cho ngành Tin sinh học trong nghiên cứu lưu trữ, giới thiệu, so sánh và dự đoán các cấu trúc proteinPROTEOMIC CẤU TRÚC (2)Định nghĩaNghiên cứu tính di truyền và các tương tác lý học giữa các protein cũng như các tương tác giữa các protein và nucleic acids hoặc các phân tử nhỏ Tính chấtPhân tích các tương tác protein có thể cung cấp không chỉ chức năng của từng loại protein mà còn về chức năng của protein trong các hệ thống và các phức hợp PROTEOMIC TƯƠNG TÁC (1)Cung cấp các thông tin có liên quan đến proteomics chức năng và phân tích vị trí protein trên phạm vi rộng Thiết kế bản đồ liên kết proteome dựa trên các tương tác đôi giữa các protein và các tương tác cao hơn được nhận biết bởi hệ thống phân tích các phức hợp proteinCác phương pháp sử dụng: HTI: high-throughput imagingY2H: yeast two hybrid systemMS, mass spectrometry, MS/MS, tandem massspectrometry.PROTEOMIC TƯƠNG TÁC (2)PROTEOMIC TƯƠNG TÁC (3)Twyman R. M. 2004. Principles of proteomics. BIOS Scientific Publishers. p35